II Centro studi dispone di una ricca Biblioteca con volumi di storia locale, soprattutto bergamasca, ma non mancano opere storiografiche relative ad altre comunità e territori della Lombardia e dell’Italia settentrionale. La Biblioteca si è arricchita nel tempo grazie agli scambi con altri Istituti e centri di ricerca, alle donazioni di privati e dei soci. Numerose le riviste di storia pervenute con la formula dello scambio nel periodo in cui il Centro pubblicava la rivista «Archivio Storico Bergamasco».
È nei programmi del Consiglio direttivo per il 2014:
a) la ricollocazione della Biblioteca, attualmente ospitata nella Biblioteca Civica Angelo Mai, nei locali della Fondazione Bergamo nella storia;
b) l’avvio della catalogazione della Biblioteca con procedura SBN (Servizio Bibliotecario Nazionale).
